Имя: Серф
Племя: Эмбрион
Оружие: Пистолет
Аватар: Варуна

Главный персонаж игры, являющийся лидером племени Эмбрион. Как и многие главные герои серии SMT, данный персонаж не обладает ни речью, ни какими-то ни было личностными качествами в самой игре, хотя судя по многочисленным роликам Серф представляет из себя довольно-таки хладнокровного командира, не проявляющего особо каких бы то ни было эмоций. Известен так же как Серебристый Лис, псевдоним которого был произнесен лидером Brutes - Mick the Slug'ом.

Символом Варуны является "Водяной ворон", чья метка располагается на левой щеке Серфа. Вооружен двумя выдвижными лезвиями, скрывающимися в руках аватара. В индуистской мифологии Варуна представляется как бог небес и океанов, а так же хранитель закона и потустороннего мира. Во времена Ведаса являлся правителем Адитьи (группа солнечных божеств, приходящиеся сыновьями Адити и Кашьяпы).

Имя: Gale
Племя: Embryon
Оружие: Штурмовая винтовка
Аватар: Vayu

Важнейший член команды Эмбрион. Приходится отличным стратегом и переговорщиком в группе. Как и Серф, Гейл является одним из самых спокойных членов команды. Помимо своих стратегических навыков так же отлично владеет ножом, который прячет у себя в подошве ботинка.

Имя: Argilla
Племя: Embryon
Оружие: Снайперская винтовка
Аватар: Prithivi

Занимает должность снайпера в группе. После происшествия на Ground Zero её больше всего волнует, кем стали её напарники, да и мир в целом. Очень эмоциональный персонаж.

Имя: Heat
Племя: Embryon
Оружие: Гранатомёт
Аватар: Agni

Еще один член команды Embryon. Товарищ надо сказать, боевой, и тот, кто осмелится противиться ему или его команде - сразу же может схлопотать по тыкве. Завидует лидерству Serph'а, задаваясь вопросами: "А чем же он лучше меня и почему не я лидер группы?".

Имя: Sera
Племя: Embryon
Оружие: Нет
Аватар: Нет

Мистическая особа, обнаруженная в районе Ground Zero. После перемещения в Junkyard у неё происходит провал в памяти, в связи с чем она не способна вспомнить цель своего визита. Очень добрая девушка, которая желает помочь своим друзьям в путешествии по миру Junkyard, стараясь найти отгадки к цели своего пребывания в этом мире. Обладает возможностью посредством пения успокаивать вышедших из под контроля аватар, но в виду того, что это неигровой персонаж, то данную способность можно лицезреть лишь в игровых сценах DDS.

Имя: Cielo
Племя: Embryon
Оружие: Автомат
Аватар: Dyaus

Пожалуй самый веселый член команды. Никогда и ни по какому поводу не унывает, готовый прийти на помощь друзьям в друдную минуту. Обладает примечательным ямайским диалектом.

Dyaus является частью индуистской мифологии и известен как "Небесный Отец" или "Небесный Бог". Так же у него есть жена - Prithivi (богиня земли).

Имя: Schrödinger
Племя: Нет
Оружие: Нет
Аватар: Нет

Загадочный кот с серебристыми глазами и таинственным колокольчиком, висящим у него на шее. Ничего особенного не делает, лишь ходит себе по миру Junkyard, да наблюдает за командой Serph'а, правда один раз помог Cielo выбраться из комнаты на базе Embryon (Сиело кинул кота в лицо охраннику, затем же быстренько ретировался). Настоящая личность этого кота будет раскрыта в Digital Devil Saga 2.