Персонаж, за которого вы и возьмете управление в данной игре. Мало что известно о нём, разве что за исключением того, что он живет в сердце города вместе со своей семьёй. Немногословен и всегда обеспокоен тем, когда его спрашивают о планах на будущее, ответы на которые он даёт не совсем внятные. После того, как он получил сообщение о встречи со своими одноклассниками в госпитале, с целью навестить своего больного учителя, город Токио был деформирован посредством действий Хикавы, главы корпорации Киберс Комьюникейшн. Выжил благодаря защитному полю госпиталя, а так же приобрёл демоническую силу, благодаря имплантированию Магатамы в его голову неким таинственным светловолосым мальчиком, став тем самым полу-демоном (Demi-fiend). С этого момента ему предначертана судьба извенить мир, оглядываясь на идеалы своих друзей, или же предотвратить его дальнейшую трансформацию, вернув его тем самым в прежнее русло.

Как и у большинства главных героев серии Megami Tensei, имя этого персонажа неизвестно, но в драма диске и комиксе за авторством Toumon Boogey он зовётся как Naoki Kashima.

Учительница высшей школы, в которой обучался протагонист со своими друзьями Исаму и Чиаки. Связана с культом Гайя и Хикава, совершившая вместе с ним апокалипсис мира, процесс которого будет назван как "Conception" (Зачатие). Она хотела сделать мир свободным, сохраня при этом высокоморальные ценности, но т.к Юко была обманута Хикавой, её мечтам не суждено было сбыться. Не обладая какой бы то ни было силой к изменению мира, она стала бродить по городу в поисках Причины (внутренней философии и ряда законов, на которых будет строится новый создаваемый мир) и поддержке у древних богов. Судя по всему она очень любила и видела толк в своих учениках, пригласив их тем самым в госпиталь, чтобы они не были уничтожены процессом Зачатия мира.

Журналист, работавший на оккультный японский журнал "Айяши". Во время изучения "Культа Гайя" Хиджири узнаёт о "Манускрипте Мироку" и о планах Хикавы по разрушению мира. Одержимый любопытством и стремящийся узнать больше о Культе Гайя и планах Хикавы, он пускается в собственное расследование, но не достигший госпиталя во время, его поглащает процесс Зачатия (Conception), как и остальной мир. Не смотря на такой внезапный поворот событий, Хиджири не исчез и не превратился в монстра, а всё так же стал изучать планы Хикавы и огромные циллиндрические устройства с начертанными на них символами, являющиеся связующим звеном между внешним миром и Сетью Амала. Хиджири сам не пытается остановить Хикаву, он просто изучает и наблюдает за тем, как будут развиваться дальнейшие события. По его словам он так же ничего не может сделать, ссылаясь на недостаток собственных сил и ради своей безопасности оставаясь лишь в точках сохранений.

Причиной, по которой он не был поглащён силой Зачатия может лишь вызвать ряд догадок, одной из которых является той, что на самом деле Хиджири был заключён в извечный круговорот смертей и перерождений, оставаясь лишь извечным наблюдателем за гибелью целых миров и цивилизаций в наказание за свершение Страшнейшего Греха. Отсюда вытекает и предположение, что Хиджири является реинкарнацией Алефа из Shin Megami Tensei II, некогда убивший самого Бога в одной из реальностей.

Чиаки приходится одноклассницей и другом детства главного героя, а так же одной из немногих выживших в событиях Tokyo Conception. Её философия основывается на мотивах Йосуга, древнего божества, которого она хочет вернуть к жизни, тем самым создав мир, в котором править будут лишь сильнейшие, а всё слабое будет уничтожаться. Возможно именно по этой причине её разум постепенно затуманивается, превращая её в монстра, делая её жестокой и чёрствой по отношению ко всему. В виду своих взглядов очень близка к армии Мантра, возглавляемой Гозу-Теннохом.

Так же приходится одноклассником и одним из друзей главного героя. В отличие от многих, его не сильно волнуют планы на будущее. Он больше любит свой внутренний мир, нежели тот, в котором он живёт. В связи с этим, после событий в Токио он становится одним из тех, кто может повлиять на становление нового мира и является сторонником идеологии Мисубы, где у каждого будет свой мир, где каждый будет жить в полной гармонии с самим собой. Изначально Исаму не был столь поглащён идеей замкнутости индивидуума, но становится одержимым после пребывания в Сети Амала.

Директор крупной коммуникационной корпорации Cybers, исчезнувший в один прекрасный день с поля зрения общественности. Телеканалы новостей вовсю вещали о пропажи данного человека, но на самом же деле он засел глубоко в подвалах госпиталя, готовившись к уничтожению и новому перерождению мира. Являвшись так же высокопоставленным членом культа Гайя, Хикава с головой начал изучение древнего "Манускрипта Мироку", расшифровав его в конечном итоге с помощью современных компьютерных технологий, что привело к трансформации мира (Conception).
После появления потустороннего мира Вортекс, Хикава создает Ассамблею Нихило, одну из самых мощных демонических групп, прислуживающих только ему и помогающих в становлении нового мира. Этот новый мир в понятиях Хикавы рассмтривается на пути Шиджимы, на единстве и спокойствии, истоки которого исходят от Буддизма и концепции Нирваны. Это будет мир абсолютной гармонии, где не будет индивидуальности, где все будут едины с Богом, где не будет войны и вражды, где будет лишь одно внутреннее умиротворение.

Загадочный мальчик и пожилая женщина встретятся на пути протагониста в госпитале, еще до событий трансформации Токио. После разрушения мира, маленький мальчик внедряет магатаму в главного героя, где тот обретает демоническую силу и возможность побороться за право вершить судьбу мира. Личность мальчика и пожилой женщины неизвестны, но вероятнее всего, что это Люцифер, принимаемый облик мальчика в реальном мире и пожилого человека в коляске в потустороннем.

В части дизайна противопоставлены маленькому мальчику и пожилой женщине, но очень похожи в поведении (к примеру, как за мальчика, так и за пожилого человека разговор ведёт женщина). Леди в чёрном и пожилой человек пребывают в глубинах Амала, что находится за гранью мира Вортекс, поглотивший реальный мир. Основная же цель человека в коляске - активировать все десять канделябров, которые освещают самые тёмные уголки глубин Амала. Активировав их, протагонист может узнать всю правду о мире Вортекс, но тогда он может лишиться последней частички своей человеческой души. Так или иначе, но некоторая часть канделябров была похищена Fiend'ами (всадники апокалипсиса), найти и отобрать у которых и поручает вам этот пожилой человек.

Всем известный охотник за демонами вселенной Devil May Cry теперь и в Shin Megami Tensei III: Nocturne Maniax! Был послан в Токио по поручению некоего пожилого человека в коляске с целью вернуть украденные Fiend'ами канделябры за вполне видимо большую сумму денег. Во время его пребывания происходит процесс трансформации Токио с миром Вортекс, но благодаря своей полу-демонической натуре Данте выживает. Встретиться с ним прийдётся ни один раз, большая часть встреч с которым приходится в лабиринте Амала. Может быть завербован в качестве союзника после прохождения этого дополнительного лабиринта.

Детектив и призыватель демонов, род Кудзуноха которого уходит в глубокое прошлое. Данный персонаж встречается в японской версии Shin Megami Tensei III: Nocturne Maniax Chronicle Edition (входившая в поставку игры Devil Summoner: Kuzunoha Raidou vs King Abaddon) и заменяет Данте в качестве охотника за головой протагониста. Ни причин, почему Кудзуноха охотится за деми-фиендом, ни разъяснений, как же он попал в наш мир и каким образом выжил при Tokyo Conception нам неизвестны. Как и во всей серии Devil Summoner: Kuzunoha Raidou его сопровождает верный помощник - кот Gouto.